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松果体是人体的第三只眼睛。说人体有第三只眼睛，似乎是不可思议。其实，生物学家早就发现，早已绝灭的古代动物头骨上有一个洞。
起初生物学家对此迷惑不解，后来证实这正是第三只眼睛的眼框。研究表明，不论是飞禽走兽，还是蛙鱼龟蛇，甚至人类的祖先，都曾有过第三只眼睛。只不过随着生物的进化，这第三只眼睛逐渐从颅骨外移到了脑内，成了“隐秘的”第三只眼。
松果体来源于神经外胚层，位置相当于第三脑室顶部。人胚33~36天时，此处室管膜增厚，即为松果体原基。有时在其前方可发生一个小突，称为副松果体，多在胚胎后期消失，但亦可残留形成为成体的囊肿。
2个月时，增厚的松果体原基向外突起，先形成小囊状，以后细胞增殖构成实质性器官，只在其基部保留一小腔，即为隐窝。松果体与间脑相连处形成松果体柄。胚胎5个月时，细胞分化为松果体细胞和神经胶质细胞，细胞逐渐成团、索状排列。
6个月时，松果体细胞明显分化，至第8个月时，松果体已近似成年型。出生后，松果体细胞停止增生，但细胞继续增大，神经胶质细胞、间质增多。
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